Академия водного транспорта Российского университета транспорта создана в 2020 году на базе Московской государственной академии водного транспорта – филиала Государственного университета морского и речного флота имени адмирала С.О. Макарова.
Академия сегодня — это один из ведущих вузов, занимающихся подготовкой плавательских и береговых кадров для воднотранспортной отрасли.